內(nèi)參蛋白抗體介紹I
Western Blot 是一種常用的初步檢測(cè)基因表達(dá)產(chǎn)物正確與否的實(shí)驗(yàn)方法,同時(shí) 它也多用于比較不同樣本中蛋白表達(dá)量的差異。但是由于 Western Blot 是一種包含 多個(gè)實(shí)驗(yàn)步驟和多種試劑的系統(tǒng)實(shí)驗(yàn),所以當(dāng)遇到結(jié)果與預(yù)期不同的情況時(shí),特別 是:全陰性結(jié)果,假陽(yáng)性結(jié)果時(shí),對(duì)于這類(lèi)結(jié)果出現(xiàn)的原因進(jìn)行分析也是十分繁瑣 的一件事情?;诖?,一個(gè)嚴(yán)謹(jǐn)?shù)?Western Blot 實(shí)驗(yàn)一般都需要設(shè)計(jì)一種合適的參 照體系,這樣便于對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行分析。常見(jiàn)的參照體系包括多種參照物,例如: 分子量 marker,空白載體對(duì)照,陰、陽(yáng)性對(duì)照樣本,內(nèi)參等等,其中內(nèi)參在結(jié)果 分析中起到至關(guān)重要的作用。
內(nèi)參(Internal Control)是指試驗(yàn)系統(tǒng)的內(nèi)部參照,一般對(duì)于哺乳動(dòng)物細(xì)胞表 達(dá)系統(tǒng)來(lái)說(shuō)是指由看家基因(house keeping gene)編碼表達(dá)的蛋白,他們?cè)诟鞣N不 同組織和細(xì)胞中的表達(dá)都相對(duì)恒定,在實(shí)驗(yàn)中檢測(cè)蛋白表達(dá)水平時(shí),將該蛋白作為 一種參照物,可用于確定樣本使用量(組織量,細(xì)胞量,上樣量等)的一致性,以 及校正實(shí)驗(yàn)過(guò)程中可能出現(xiàn)的操作誤差,以進(jìn)一步保證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。所以在 展示 Western Blot 實(shí)驗(yàn)結(jié)果時(shí),內(nèi)參數(shù)據(jù)的提供是十分重要的。
現(xiàn)在實(shí)驗(yàn)中常用的內(nèi)參蛋白包括:細(xì)胞骨架蛋白 beta-actin,beta-tubulin, GAPDH(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)等。一般為了便于分辨目的蛋 白分子和內(nèi)參,建議這兩者間的分子量相差大于 5kD。
Actin 是肌動(dòng)蛋白,一種重要的細(xì)胞骨架蛋白,他共分為 6 種亞型,包括: alpha-skeletal muscle actin、alpha-cardiac muscle actin、alpha-smooth muscle actin 和 gamma-smooth muscle actin、beta-actin (β-non-muscle)和 gamma-non-muscle actin, 其中前 4 種是組織特異性的,而后兩種廣泛分布于各種組織中。但是常用作 Western Blot 內(nèi)參的 beta-actin(分子量約 42kd)實(shí)際上在肌肉組織中的分布很少,所以如 果選用 beta-actin 特異性的肽段(如:N-端肽段)作為免疫原制備的抗體可能在肌 肉組織中就不能得到陽(yáng)性信號(hào),而用 beta-actin 中與其他 actin 序列同源性高的肽段 作為免疫原制備的抗體就能在包括肌肉組織在內(nèi)的多種組織中檢測(cè)到陽(yáng)性信號(hào),而 可作為一種廣泛可用的內(nèi)參對(duì)照。與 abcam 和 sigma 常用的 N 段或者 C 端肽段制 備抗體不同的是,Cloud-Clone Corp.制備的 beta-actin 內(nèi)參抗體 PAB340Mi 是基于 該蛋白的全長(zhǎng)序列的,經(jīng)過(guò) Western Blot 顯示:該抗體可以識(shí)別包括心肌組織在內(nèi) 的多種組織中的 beta-actin,同時(shí)由于該蛋白在不同物種中的高度保守性,所以可 用于多物種樣本的內(nèi)參蛋白識(shí)別。
圖 1 PAB340Mi 使用于不同組織中的 Western Blot 圖
Tubulin 即微管蛋白,同樣是一種重要的細(xì)胞骨架蛋白。Tubulin 分為 alpha、 beta、gamma、delta,epsilon 等多種亞型,由于其中的 beta-tubulin(分子量約 50kd) 具有與 beta-actin 類(lèi)似的特點(diǎn),所以也多用作 Western Blot 內(nèi)參,Cloud-Clone Corp. 制備的 beta-tubulin 內(nèi)參抗體 PAB870Mi01 同樣可作為多物種樣本的內(nèi)參抗體用于 Western Blot 實(shí)驗(yàn)中。
GAPDH,甘油醛-3-磷酸脫氫酶,是參與糖酵解的一種關(guān)鍵酶,其分子量約 36kd,也是一種常用的內(nèi)參蛋白,Cloud-Clone Corp.研發(fā)的該內(nèi)參抗體 PAB932Hu01 lane 10 kidney lane 11 spleen lane 12 liver lane 13 lung lane 14 brain lane 15 heart 和 PAB932Hu02,其免疫原分別為含有 Gly2~Ser148 和 Thr154~Val324 兩段序列的 重組蛋白,均可以用作 Western Blot 實(shí)驗(yàn)中的內(nèi)參抗體。使用該蛋白作為內(nèi)參時(shí)還 需注意一點(diǎn):由于組織缺氧、糖尿病等因素會(huì)導(dǎo)致 GAPDH 的表達(dá)增高,在使用該 類(lèi)組織細(xì)胞樣本時(shí),不適合使用 GAPDH 做為內(nèi)參。
而針對(duì)細(xì)胞核內(nèi)參,Cloud-Clone Corp.也研發(fā)制備了抗組蛋白 Histone H3 和增 殖細(xì)胞核抗原 PCNA 的抗體,PAA285Mi01 是針對(duì)染色體組成型表達(dá)的 H3 蛋白的 特異性抗體,PAA591Mi01 是針對(duì)細(xì)胞核內(nèi)合成的 PCNA 蛋白的抗體,已被多位研 究工作者用作核內(nèi)參抗體。
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