蛋白質印跡常見問題及解決辦法
蛋白質印跡(Western Blot)是根據抗原抗體特異性結合的原理檢測復雜樣本 中的某種蛋白的方法。將混合抗原樣本在凝膠板上進行單向或雙向電泳,經過 PAGE 分離的蛋白質樣品,轉移到固相載體上,固相載體以非共價鍵形式吸附蛋白 質,且能保持電泳分離的類型及其生物學活性不變。以固相載體上的蛋白質或多肽 作為抗原,與對應的抗體起免疫反應,再與或標記的第二抗體起反應,經過底物顯 色或放射自顯影以檢測電泳分離的特異性目的基因表達的蛋白成分。該技術廣泛應 用于鑒定蛋白以及對蛋白進行定性和半定量分析。
蛋白質印跡分為蛋白質分離、蛋白質印跡和蛋白質鑒定三個步驟。每個步驟和 環(huán)節(jié)都可能影響到最終結果, 要想獲得理想的實驗結果,每個步驟都不能馬虎?,F(xiàn) 就實驗中遇到的常見問題進行分析總結,給出解決方案,以提高蛋白質印跡實驗的 成功率。
1.蛋白質分離-電泳中的問題
蛋白質印跡實驗是建立在聚丙烯酰胺凝膠電泳 SDS-PAGE 基礎上的,所以蛋 白質印跡有些問題是由前期電泳引起的。因此,在此簡單介紹電泳中出現(xiàn)的問題。
出現(xiàn)的問題 | 可能的原液 | 處理方法 | 圖例 |
A. “ 微笑”() 形帶 | 凝膠濃度過高; 凝膠中部凝固不均勻,多 出現(xiàn)于較厚的凝膠中; 電泳系統(tǒng)溫度偏高 | 選擇合適濃度的凝膠; 待凝膠充分凝固后再做實 驗; 水浴降溫電泳。 | |
B.“皺眉”()形 帶 | 裝置不合適,特別可能是 凝膠和玻璃擋板底部有 氣泡。 | 可在兩板間加入適量緩沖 液,以排除氣泡 | |
C 拖尾 | 樣品融解效果不佳 分離膠濃度過大引起的 | 加樣前離心; 選擇適當的樣品緩沖液, 加適量樣品促溶劑; 重新配制電泳緩沖液; 降低凝膠濃度; | |
D 紋理 | 樣品不溶性顆粒引起的 | 加樣前離心; 加適量樣品促溶劑; | |
E 條帶偏斜 | 電極不平衡或者加樣位 置偏斜 | 檢查電極是否接觸良好; 拔梳子的時候動作輕柔, 保證加樣孔的平坦; | |
F 條帶向兩邊擴 散 | 加樣量過多 | 樣本在上樣前先進行蛋白 定量,根據具體濃度選擇 合適的上樣量; |
2.蛋白質轉印-轉膜中的問題
轉膜是蛋白質印跡實驗中關鍵的一步。轉膜不完全和轉膜過度都會導致轉膜效 率低,而導致在檢測鑒定是出現(xiàn)信號弱或無信號的情況出現(xiàn)。優(yōu)化轉膜條件可有效 提高轉膜效率。
表2. 轉膜中的問題及解決方法
出現(xiàn)的問題 | 建議 |
不完全轉膜 | 將轉膜后的膠染色確定轉膜效率;同時可用麗春紅染膜; |
優(yōu)化轉印時間和電流,分子量大的蛋白可以適度延長轉印時間; | |
實驗中加入陽性對照和/或 Marker; | |
按照膜的使用說明預先潤濕膜; | |
轉膜過程中膠與膜完全接觸, |