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CRISPR/Cas9和Argonaute基因編輯技術(shù)簡(jiǎn)介

隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展,人們對(duì)疾病認(rèn)識(shí)的進(jìn)一步深入,發(fā)現(xiàn)人類(lèi)很多疾病的發(fā)病原因與基因突變有著密不可分的關(guān)系。那么如何去治療這些疾病呢?人們自然想到了采用一些技術(shù)手段對(duì)突變的基因序列進(jìn)行重新編輯,以期達(dá)到治愈的目的,這項(xiàng)技術(shù)就是基因編輯技術(shù)?;蚓庉嫾夹g(shù)經(jīng)過(guò)了以歸巢酶,ZFN,TALEN等以蛋白質(zhì)與DNA識(shí)別與切割為原理的第一代基因編輯技術(shù)的發(fā)展,人們對(duì)基因編輯技術(shù)的認(rèn)識(shí)不斷加深,但是由于第一代基因編輯技術(shù)操作步驟繁瑣、基因編輯效率低下、基因編輯脫靶現(xiàn)象嚴(yán)重等問(wèn)題,很難應(yīng)用于生產(chǎn)實(shí)踐。2003年,MIT小組首次利用原核生物中CRISPR/Cas9 系統(tǒng)對(duì)真核生物基因完成了編輯,該技術(shù)操作步驟簡(jiǎn)單、基因編輯效率高、基因編輯脫靶現(xiàn)象不明顯等,形成了以CRISPR/Cas9為代表,以RNA與DNA的識(shí)別與蛋白質(zhì)介導(dǎo)的切割為基本原理的第二代基因編輯技術(shù)。2016年,韓春雨團(tuán)隊(duì)利用原核生物中Argonaute系統(tǒng),完成對(duì)真核生物基因的編輯,該技術(shù)相比于CRISPR/Cas9系統(tǒng)操作更為簡(jiǎn)單、基因編輯效率更高、基因編輯脫靶現(xiàn)象更低、對(duì)基因在染色體中所在的位置沒(méi)有明確要求等,該項(xiàng)技術(shù)極有可能成為以DNA與DNA的識(shí)別與蛋白質(zhì)介導(dǎo)的切割為基本原理的第三代基因編輯技術(shù)。下面我們將詳細(xì)介紹CRISPR/Cas9系統(tǒng)和Argonaute系統(tǒng)為基礎(chǔ)的基因編輯技術(shù)。

1、CRISPR/Cas9系統(tǒng)為基礎(chǔ)的基因編輯技術(shù)

CRISPR/Cas9的結(jié)構(gòu)由Cas9的編碼區(qū)、前導(dǎo)序列和一個(gè)由不連續(xù)的重復(fù)序列R與長(zhǎng)度相似的間區(qū)序列S間隔排列而成的CRISPR 簇組成,廣泛存在于原核生物。在原核生物中,外源的DNA插入到基因組,一旦插入DNA開(kāi)始轉(zhuǎn)錄,生物體會(huì)將臨近PAM(NGG序列)的序列切割形成短片段,添加到CRISPR 簇中。當(dāng)相同的外源DNA再次插入時(shí),Cas9會(huì)特異性的結(jié)合CRISPR 簇中轉(zhuǎn)錄出的RNA短片段(引導(dǎo)RNA),Cas9與RNA結(jié)合的復(fù)合體會(huì)被轉(zhuǎn)運(yùn)到核內(nèi),識(shí)別PAM完成對(duì)全基因組的掃描,一旦出現(xiàn)能與RNA互補(bǔ)的DNA序列,Cas9將對(duì)這段DNA進(jìn)行剪切,阻斷外源DNA的入侵?;谶@個(gè)原理,只要人為的將CRISPR/Cas9系統(tǒng)通過(guò)腺病毒或慢病毒包裝等,侵入哺乳動(dòng)物細(xì)胞,根據(jù)插入CRISPR簇中的序列(至少與基因組上19個(gè)堿基完全匹配)識(shí)別剪切的位點(diǎn),便完成對(duì)真核細(xì)胞基因組的定點(diǎn)剪切。切割完成后,目的位點(diǎn)會(huì)出現(xiàn)雙鏈斷裂(DSB),并在一定條件下引起生物體的主動(dòng)修復(fù)(HDR (同源介導(dǎo)的雙鏈DNA修復(fù))和NHEJ(非同源性末端結(jié)合))。

基于CRISPR/Cas9系統(tǒng)的基因敲出實(shí)驗(yàn)流程:1、構(gòu)建含有核定位信號(hào)(NLS)的Cas9基因的質(zhì)粒以及能產(chǎn)生誘導(dǎo)RNA(需提前設(shè)計(jì))的質(zhì)粒;2、包裝病毒,滴度檢驗(yàn);3、侵染哺乳動(dòng)物細(xì)胞;4、通過(guò)ELISA、WB、熒光實(shí)時(shí)定量等檢測(cè)敲除效果。

2、Argonaute系統(tǒng)為基礎(chǔ)的基因編輯技術(shù)

    Argonaute的結(jié)構(gòu)由Argonaute的編碼區(qū)、5'磷酸化雙鏈短DNA(ssDNA)組成,目前僅在部分原核生物中發(fā)現(xiàn)。在真核生物細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)中基本不存在5'磷酸化的ssDNA,Argonaute通過(guò)腺病毒或慢病毒包裝、脂質(zhì)體、電擊等,侵入哺乳動(dòng)物細(xì)胞,而5'磷酸化的ssDNA主要通過(guò)人工合成直接導(dǎo)入細(xì)胞,細(xì)胞表達(dá)Argonaute會(huì)特異性的與5'磷酸化的ssDNA結(jié)合,結(jié)合產(chǎn)物會(huì)被轉(zhuǎn)運(yùn)到核內(nèi),通過(guò)ssDNA(最佳為24bp與基因組完全匹配)識(shí)別剪切位點(diǎn),完成對(duì)真核細(xì)胞基因組的定點(diǎn)剪切。切割完成后,目的位點(diǎn)會(huì)出現(xiàn)雙鏈斷裂,并在一定條件下引起生物體的主動(dòng)修復(fù)。

    基于Argonaute系統(tǒng)的基因敲出實(shí)驗(yàn)流程:1、構(gòu)建含有核定位信號(hào)(NLS)的Argonaute基因的質(zhì)粒以及人工合成ssDNA(需提前設(shè)計(jì));2、將質(zhì)粒和ssDNA包裹形成脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染染哺乳動(dòng)物細(xì)胞(也可利用電轉(zhuǎn));3、通過(guò)ELISA、WB、熒光實(shí)時(shí)定量等檢測(cè)敲除效果。

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