內(nèi)參蛋白抗體介紹III
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我們知道,內(nèi)參蛋白是指由管家基因(house keeping gene)編碼表達(dá)的一類蛋白,它們在各組織和細(xì)胞中的表達(dá)相對恒定,在實(shí)驗(yàn)中檢測蛋白的表達(dá)水平變化時(shí)常用它們來做參照物。
這些內(nèi)參蛋白常應(yīng)用于Western Blot中,Western Blot不僅能證明樣品中是否含有某種蛋白,還能比較不同條件、不同組織和細(xì)胞中目的蛋白的相對含量,從而衡量蛋白的表達(dá)水平。內(nèi)參蛋白作為一種參照物,在其中的作用為確定樣本使用量的一致性,以及校正實(shí)驗(yàn)過程中可能出現(xiàn)的操作誤差,從而進(jìn)一步保證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。那么對于不同的蛋白,內(nèi)參蛋白該如何選擇呢?
前面兩節(jié)已經(jīng)介紹了幾種常見內(nèi)參蛋白的選擇和應(yīng)用,這一節(jié)我們將系統(tǒng)介紹不同內(nèi)參蛋白的選擇及云克隆公司現(xiàn)有內(nèi)參蛋白抗體。
對于內(nèi)參蛋白的選擇首先是考慮分子量。一般情況下,內(nèi)參蛋白和檢測的目的蛋白最好相差在5kDa以上。如分子量為45kDa的檢測蛋白,我們可以選擇Tubulin Beta(54kDa),Lamin B1(66kDa)等,而不選擇ACTa2(42kDa)或者beta-actin(45kDa)。
其次對于不同的組織,應(yīng)選擇不同的內(nèi)參。如肌動(dòng)蛋白是一種細(xì)胞骨架蛋白,有六種不同的亞型,包括: alpha-skeletal muscle actin、alpha-cardiac muscle actin、alpha-smooth muscle actin、gamma-smooth muscle actin、beta-actin (β-non-muscle)和 gamma-non-muscle actin。其中常用作 Western Blot 內(nèi)參的beta-actin在肌肉和脂肪組織中分布較少,那么若樣本是心肌或脂肪組織來源的,就可以考慮分別用alpha-cardiac muscle actin (ACTC1)和GAPDH作為內(nèi)參蛋白。
最后,提取蛋白的部位不同,選擇的內(nèi)參蛋白也不同。比如有時(shí)胞質(zhì)、胞核分開提取而不提取總蛋白時(shí),就要選擇相應(yīng)部位表達(dá)的內(nèi)參蛋白。如PCNA在細(xì)胞核中高效穩(wěn)定表達(dá),理論上在細(xì)胞質(zhì)不表達(dá),那么對于胞質(zhì)提取的蛋白,就不能選用PCNA作為內(nèi)參蛋白,而應(yīng)該選擇細(xì)胞質(zhì)中表達(dá)的Tublin Beta、Actin Beta等作為內(nèi)參蛋白。
云克隆針對蛋白表達(dá)的不同細(xì)胞部位,不同組織,以及不同的分子量,推出一系列的內(nèi)參抗體,滿足使用者的不同需求。見表1。
表1. 各種內(nèi)參蛋白抗體
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? 內(nèi)參蛋白(靶蛋白) ? | 亞細(xì)胞定位 | 目標(biāo)蛋白的分子量 | ?目標(biāo)蛋白的組織表達(dá)部??位 |
甘油醛-3-磷酸脫氫酶(GAPDH) | 胞質(zhì),核,膜 | 36kDa | 胰腺,乳腺,胃等 |
細(xì)胞外信號(hào)調(diào)節(jié)激酶1(ERK1) | 胞質(zhì),核 | 43kDa | 腦,小腸,食道等 |
細(xì)胞外信號(hào)調(diào)節(jié)激酶2(ERK2) | 胞質(zhì),核 | 42kDa | 腎,乳腺,睪丸等 |
組蛋白H3(Histone H3) | 核 | 17kDa | 肝,腎,肺,睪丸,胃等 |
抗增殖細(xì)胞核抗原(PCNA) | 核 | 35kDa | 睪丸,小腸,甲狀腺等 |
核纖層蛋白B1(LMNB1) | 核 | 66kDa | 腦,肝等 |
核纖層蛋白A/C(LMNA) | 核 | 74kDa | 平滑肌 |
平滑肌肌動(dòng)蛋白α2(ACTa2) | 胞質(zhì) | 42kDa | 平滑肌,乳腺等 |
心肌肌動(dòng)蛋白α1(ACTC1) | 胞質(zhì) | 42kDa | 肌肉 |
肌動(dòng)蛋白β(ACTb) | 胞質(zhì) | 45kDa | 闌尾,脾扁桃體,胃,乳腺等 |
微管蛋白β(TUBb) | 胞質(zhì) | 54kDa | 腦,睪丸,皮膚,結(jié)腸等 |
70kDa熱休克蛋白1A(HSPA1A) | 胞質(zhì) | 70kDa | 食道,甲狀腺等 |
連環(huán)蛋白β1(CTNNb1) | 胞質(zhì) | 85kDa | 結(jié)腸,皮層神經(jīng)元等 |
紐蛋白(VCL) | 胞質(zhì) | 124kDa | 肌肉 |
電壓依賴性陰離子通道蛋白1(VDAC1) | 線粒體外膜 | 31kDa | 肺,肝,睪丸,胎盤等 |
鈣聯(lián)蛋白(CNX) | 內(nèi)質(zhì)網(wǎng) | 90kDa | 腦,胃,腎等 |
轉(zhuǎn)鐵蛋白受體(TFR) | 細(xì)胞膜 | 85kDa | 肝 |
鈉/鉀離子轉(zhuǎn)運(yùn)ATP酶α1肽(ATP1a1) | 細(xì)胞膜 | 113kDa | 甲狀腺,胰腺,前列腺等 |
血小板衍生生長因子受體α(PDGFRa) | 細(xì)胞膜 | 123kDa | 血小板,腦,心 |
細(xì)胞色素C氧化酶亞基IV亞型1(Cytochrome C Oxidase Subunit IV Isoform 1, COX4I1) | 線粒體內(nèi)膜 | 20kDa | 肌肉,腦,肝,腎等 |
TATA盒結(jié)合蛋白(TATA Binding Protein, TBP) | 核 | 38kDa | 睪丸,卵巢等 |
組蛋白脫乙酰基酶1(Histone Deacetylase 1,HDAC1) | 核 | 55kDa | 心,胰腺,睪丸等 |
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