蛋白質(zhì)印跡(Western Blot)實驗操作流程
1.制膠
1)試劑
濃縮膠緩沖液:1M Tris-HCl, pH 6.8, 0.4% SDS
分離膠緩沖液:1.5M Tris-HCl, pH 8.8, 0.4% SDS
丙烯酰胺儲存液:29%丙烯酰胺+1.0%亞甲雙丙烯酰胺
10%過硫酸銨
TEMED(N,N,N‘,N’-四亞甲基乙二胺)
電泳緩沖液:0.025M Tris Base, 0.192M Glycine, 0.1% SDS
考馬斯亮藍凝膠染色液:0.2%考馬斯亮藍R-250,30%甲醇,10%乙酸
考馬斯亮藍凝膠脫色液:30%甲醇,10%乙酸
2)設(shè)備
微型凝膠裝置:Bio-Rad Mini-Protean 3 Dodeca Cell
電源:Bio-Rad PowerPac HC
梯度凝膠儀:Bio-Rad Model 485 Gradient Former
3)實驗操作
在燒杯中按如下成分配制凝膠液,灌注凝膠前應(yīng)加入過硫酸銨和TEMED。
分離膠(10 ml) | 濃縮膠(2ml、6ml) | |||||
分離/濃縮膠濃度 | 8% | 10% | 12% | 15% | 5% | 5% |
分離膠緩沖液 | 2.5 | 2.5 | 2.5 | 2.5 | — | — |
濃縮膠緩沖液 | — | — | — | — | 0.25 | 0.75 |
丙烯酰胺儲存液 | 2.6 | 3.3 | 4 | 5 | 0.33 | 1 |
ddH2O | 4.8 | 4.1 | 3.4 | 2.4 | 1.4 | 4.2 |
10% 過硫酸銨 | 0.1 | 0.08 | 0.08 | 0.08 | 0.02 | 0.06 |
TEMED | 0.06 | 0.04 | 0.04 | 0.04 | 0.002 | 0.006 |
2. 灌注分離膠
加入過硫酸銨和TEMED后,立即輕輕混合,將溶液小心倒入膠槽。當(dāng)分離膠溶液高度達到約150px時停止灌注,在分離膠溶液上倒入約0.5ml異丙醇,以保持凝膠表面平整,靜止放置10-30min使凝膠凝固。
3. 灌注濃縮膠
當(dāng)分離膠凝固后,分離膠和異丙醇之間會出現(xiàn)一個分離界面。去除異丙醇,用蒸餾水沖洗表面。加入過硫酸銨和TEMED后,立即輕輕混合濃縮膠,將溶液倒入膠槽,直到溶液到達前板頂部。小心地將梳子插入凝膠中,直到梳子的底部到達前板的頂端,靜止放置10-30min使凝膠凝固。
4. 加樣
濃縮凝膠凝固后,拆卸梳子,將凝膠放入電泳室,在內(nèi)外儲層加電泳緩沖液。將樣本和適量蛋白質(zhì)標(biāo)記裝入孔中(每個樣本20-25ug總蛋白)
5. 凝膠電泳
蓋上蓋子,并將電極插頭連接到合適的電極上。打開電源調(diào)整電壓至80V,電泳約30分鐘。當(dāng)樣品形成單條窄線并進入分離膠時,將電壓轉(zhuǎn)換為150V,當(dāng)移至凝膠底部時,停止電泳。大約需要40-60min。
6. 凝膠轉(zhuǎn)移
1)試劑
10X轉(zhuǎn)膜液:0.25M Tris, 1.92M甘氨酸,稀釋至1X緩沖液后加入甲醇使其濃度為10%,需現(xiàn)配現(xiàn)用。
封閉液:1 X PBS, pH=7.4加入5.0%脫脂奶粉
PVDF膜
2)設(shè)備
轉(zhuǎn)膜儀:Bio-Rad Trans-Blot Cell
電源:Bio-Rad PowerPac H
7. 電轉(zhuǎn)
依次將PVDF膜置于100%甲醇中30秒,轉(zhuǎn)膜液中至少1min。按照說明書裝好電轉(zhuǎn)儀,在電轉(zhuǎn)儀上一次鋪好海綿、濾紙、膜、膠、濾紙、海綿,填充預(yù)冷轉(zhuǎn)膜緩沖液,并將電極連接起來。將電流設(shè)置為50 mA,轉(zhuǎn)膜過夜。
8. 封閉
將PVDF膜轉(zhuǎn)移至封閉液中。在搖床上室溫搖動1小時,或4℃過夜。
蛋白質(zhì)印跡
1)試劑
20×TBS (pH7.4):0.1M Tris, 1M NaCl。
TBST溶液:1×TBS, 0.05% Tween-20。
抗體稀釋液:將5%脫脂奶粉加入到TBST溶液中,現(xiàn)配現(xiàn)用。
顯影液/定影液
洗膜緩沖液: TBST
一抗
二抗:如山羊抗兔IgG(SAA544Rb19)
辣根過氧化物酶底物
X線
2)設(shè)備
搖床
9. 孵育一抗
1) 用抗體稀釋液稀釋一抗至合適的濃度,在室溫下用振動孵育1小時或4℃振動孵育過夜。
2) 洗膜:倒出一抗溶液,用洗膜緩沖液洗膜3次,每次5min。
10. 孵育二抗
1) 用抗體稀釋液稀釋二抗(1:5000,山羊抗兔IgG),室溫下用振動孵育1小時。
2) 洗膜:倒出二抗溶液,用洗膜緩沖液洗膜3次,每次5min。
11. 暗室曝光
在暗室里,將PVDF膜浸潤在ECL底物溶液1min左右,然后用保鮮膜將PVDF膜包好,放入暗盒,進行顯影曝光。