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系統(tǒng)性紅斑狼瘡遺傳研究新發(fā)現(xiàn)

系統(tǒng)性紅斑狼瘡 (SLE) 是一種自身免疫性疾病,其特征是產(chǎn)生針對(duì)多種細(xì)胞成分的自身抗體。SLE 的臨床表現(xiàn)高度異質(zhì),包括皮膚、肌肉骨骼、腎臟、血液、神經(jīng)和其他部位不同的癥狀。迄今為止,已有近180個(gè)基因組位點(diǎn)在多個(gè)遺傳研究中被鑒定為與SLE易感性相關(guān)。最近的遺傳學(xué)研究利用不同的細(xì)胞類型特異性表觀遺傳資源和其他生物資源來(lái)更好地描繪疾病發(fā)病機(jī)制,從而更新 SLE 的遺傳結(jié)構(gòu),這可能有助于更好地評(píng)估SLE的遺傳風(fēng)險(xiǎn)程度,并提供更有效的藥物靶點(diǎn)。


1. 基因組測(cè)序和功能分析確定與SLE相關(guān)的 MAP4K3/GLK 種系和體細(xì)胞變異

MAP4K3 (GLK) T 細(xì)胞中的過(guò)表達(dá)誘導(dǎo)IL-17A 的產(chǎn)生和自身免疫反應(yīng)。過(guò)表達(dá) GLK T 細(xì)胞群與人類SLE的嚴(yán)重程度相關(guān);然而,目前尚不清楚 GLK 如何在 SLE 患者中上調(diào)。臺(tái)灣國(guó)立衛(wèi)生研究院免疫學(xué)研究中心Tse-Hua Tan團(tuán)隊(duì)在兩個(gè)獨(dú)立隊(duì)列中招募了 181 SLE 患者和 250 名非 SLE 個(gè)體,對(duì)外周血單個(gè)核細(xì)胞的基因組 DNA 進(jìn)行二代測(cè)序以鑒定 GLK 基因變異[1]。他們從隊(duì)列中發(fā)現(xiàn)58SLE患者GLK 3 ' -UTR的體細(xì)胞變異頻率較高,血清抗雙鏈DNA水平升高,血清C3/C4水平降低。這種3 ' -UTR的體細(xì)胞變異增強(qiáng)了T細(xì)胞中GLK mRNA的水平。此外,在隊(duì)列中發(fā)現(xiàn)了5例具有GLK (A410T)種系變異的SLE患者,以及2例具有GLK (K650R)種系變異的SLE患者。GLK (A410T)GLK (K650R)突變體均能抑制新型E3連接酶MKRN4誘導(dǎo)的GLK泛素化,導(dǎo)致GLK蛋白穩(wěn)定(1)。這些結(jié)果提示多個(gè) GLK 種系和體細(xì)胞變異通過(guò)增加 SLE 患者的 mRNA 或蛋白質(zhì)穩(wěn)定性來(lái)誘導(dǎo) GLK,攜帶上述 GLK 種系或體細(xì)胞變異體的個(gè)體可能有著較高的SLE患病風(fēng)險(xiǎn)。

 

2. 單細(xì)胞 RNA-seq 揭示細(xì)胞類型特異性分子和遺傳與SLE的關(guān)聯(lián)

盡管近年來(lái)對(duì)與 SLE 相關(guān)基因座的研究取得進(jìn)展,但對(duì) SLE 中循環(huán)免疫細(xì)胞的全面普查仍然不完整,并且注釋介導(dǎo)遺傳關(guān)聯(lián)的細(xì)胞類型和環(huán)境仍然具有挑戰(zhàn)性。美國(guó)加州大學(xué)舊金山分校醫(yī)學(xué)系風(fēng)濕病科Chun Jimmie Ye團(tuán)隊(duì)使用多重單細(xì)胞 RNA 測(cè)序 (mux-seq) 對(duì)162SLE患者和99名亞洲或歐洲血統(tǒng)的健康對(duì)照者中的120多萬(wàn)個(gè)外周血單核細(xì)胞進(jìn)行了分析[2]。分析結(jié)果顯示SLE患者單核細(xì)胞中 1 型干擾素刺激基因 (ISG) 的表達(dá)升高,與單核細(xì)胞 ISG 表達(dá)相關(guān)的初始 CD4+ T 細(xì)胞減少,以及細(xì)胞毒性 GZMH+ CD8+ T 細(xì)胞的擴(kuò)增(2)。通過(guò)整合基因分型數(shù)據(jù)和使用一種新的矩陣分解方法,他們?cè)?/span>8種細(xì)胞類型中繪制了細(xì)胞類型特異性的順式表達(dá)數(shù)量性狀位點(diǎn)(cis-eQTL)。對(duì)cis-eQTLs和全基因組關(guān)聯(lián)研究結(jié)果的聯(lián)合分析使免疫介導(dǎo)疾病相關(guān)細(xì)胞類型的鑒定、疾病相關(guān)位點(diǎn)的精細(xì)定位和新的SLE關(guān)聯(lián)的發(fā)現(xiàn)成為可能。通過(guò)相互作用分析,在患者中發(fā)現(xiàn)了干擾素激活后對(duì)基因表達(dá)產(chǎn)生影響的變異。他們的研究證明 mux-seq 可作為一種系統(tǒng)方法來(lái)表征細(xì)胞組成,識(shí)別細(xì)胞類型特異性轉(zhuǎn)錄組特征,并注釋與 SLE 相關(guān)的遺傳變異。

 

3. TLR7功能獲得性遺傳變異導(dǎo)致人類SLE

盡管間接證據(jù)支持增強(qiáng)的 Toll 樣受體 7 (TLR7) 信號(hào)傳導(dǎo)是人類系統(tǒng)性自身免疫疾病的一種機(jī)制,但缺乏導(dǎo)致狼瘡的 TLR7 基因變異的證據(jù)。澳大利亞國(guó)立大學(xué)約翰·科廷醫(yī)學(xué)研究學(xué)院免疫學(xué)和傳染病系Carola G. Vinuesa團(tuán)隊(duì)描述了由TLR7功能獲得變異引起的人類SLE[3]。他們?cè)谝幻麌?yán)重狼瘡兒童中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)全新的錯(cuò)義TLR7Y264H變異。TLR7Y264H變體選擇性地增加了鳥(niǎo)苷和2',3'-cGMP的親和力,并足以導(dǎo)致小鼠狼瘡。TLR7信號(hào)通路的增強(qiáng)會(huì)導(dǎo)致B細(xì)胞受體激活的B細(xì)胞的異常存活,并導(dǎo)致CD11c+年齡相關(guān)的B細(xì)胞和生發(fā)中心B細(xì)胞的積累。MyD88 (TLR7的下游接頭蛋白)的缺失拯救了自身免疫、異常B細(xì)胞存活以及所有細(xì)胞和血清學(xué)表型(3)。這一研究確定了TLR7和含鳥(niǎo)苷的自身配體在人類SLE發(fā)病中的重要性,為靶向TLR7MyD88的療法開(kāi)發(fā)提供幫助。

 

參考文獻(xiàn)

[1]Chuang HC, Hung WT, Chen YM, et al. Genomic sequencing and functional analyses identify MAP4K3/GLK germline and somatic variants associated with systemic lupus erythematosus [J]. Ann Rheum Dis. 2022, 81(2):243-254. (IF=19.103)

[2]Perez RK, Gordon MG, Subramaniam M, et al. Single-cell RNA-seq reveals cell type-specific molecular and genetic associations to lupus [J]. Science. 2022, 376(6589):eabf1970. (IF=47.728)

[3]Brown GJ, Ca?ete PF, Wang H, et al. TLR7 gain-of-function genetic variation causes human lupus [J]. Nature. 2022, 605(7909):349-356. (IF=49.967)


 自身免疫(autoimmunity)是在正常情況下,動(dòng)物的免疫系統(tǒng)只對(duì)自身以外的異物抗原發(fā)生反應(yīng),但由于某些原因?qū)ψ陨順?gòu)成成分引起免疫反應(yīng)時(shí),則稱為自身免疫。自身免疫在哺乳動(dòng)物中廣泛存在,在正常條件下被視為機(jī)體正常防御的一部分,但是一旦自身免疫出現(xiàn)紊亂,便可以致病,出現(xiàn)自身免疫性疾病,比如:系統(tǒng)性紅斑性狼瘡、慢性淋巴細(xì)胞性甲狀腺炎以及自身免疫性溶血等。現(xiàn)在一般認(rèn)為自身免疫疾病的發(fā)病是個(gè)極其復(fù)雜的過(guò)程,涉及面較廣,與遺傳、病毒感染、免疫功能狀況等密切相關(guān),而抑制性T 細(xì)胞功能降低及有免疫原性的自身抗原形成是其發(fā)病的中心環(huán)節(jié)。


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