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文獻(xiàn)解讀 | 小鼠組織中巨噬細(xì)胞的整合蛋白質(zhì)組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)景觀

2022年11月30日,復(fù)旦大學(xué)中山醫(yī)院生命科學(xué)學(xué)院基因工程國家重點實驗室Chen Ding團隊在《Nature Communications》上發(fā)表題為“Integrated proteomic and transcriptomic landscape of macrophages in mouse tissues”的文章,提供了不同組織中巨噬細(xì)胞群體的蛋白質(zhì)組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。

在這篇文章中,云克隆試劑盒【干擾素γ(IFNg)檢測試劑盒(酶聯(lián)免疫吸附試驗法),SEA049Mu】受到科研工作者的認(rèn)可,榮登優(yōu)秀國際期刊。

巨噬細(xì)胞參與組織內(nèi)穩(wěn)態(tài),對先天免疫反應(yīng)至關(guān)重要,但不同組織中不同的巨噬細(xì)胞群體表現(xiàn)出不同的基因表達(dá)模式和生物過程。雖然已經(jīng)報道了組織特異性巨噬細(xì)胞表觀基因組和轉(zhuǎn)錄組譜,但不同巨噬細(xì)胞種群的蛋白質(zhì)組仍然很不確定。巨噬細(xì)胞異質(zhì)性的表觀基因組和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的新證據(jù)普遍證明了環(huán)境效應(yīng)對組織駐留巨噬細(xì)胞特化的重要性。因此,有必要對巨噬細(xì)胞蛋白質(zhì)組的異質(zhì)性進(jìn)行分析。

在這項研究中,作者使用質(zhì)譜和bulk RNA測序分別評估了來自小鼠組織、骨髓來源的巨噬細(xì)胞和細(xì)胞系RAW264.7的10個原代巨噬細(xì)胞群體的蛋白質(zhì)組和轉(zhuǎn)錄組模式。結(jié)果顯示組織駐留和募集的巨噬細(xì)胞之間存在不同的蛋白質(zhì)組學(xué)景觀和蛋白質(zhì)拷貝數(shù)。分層調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建發(fā)現(xiàn)巨噬細(xì)胞的細(xì)胞型特異性轉(zhuǎn)錄因子是單個巨噬細(xì)胞亞群的組織和功能特性的樞紐。最后,IL18被驗證為區(qū)分肺和肝臟中組織駐留和募集巨噬細(xì)胞之間的分子特征和細(xì)胞功能特征所必需的。

綜上所述,作者的研究提供了不同組織中巨噬細(xì)胞群體的蛋白質(zhì)組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。這一豐富的資源不僅揭示了不同巨噬細(xì)胞群體的功能多樣性,還可以作為未來巨噬細(xì)胞生物學(xué)研究的起點,從而更好地了解全身巨噬細(xì)胞的免疫相關(guān)和非免疫相關(guān)功能。