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免疫調控新發(fā)現:CMTM6通過調節(jié)CD58和PD-L1的蛋白表達影響T細胞抗腫瘤反應

眾所周知,T細胞在腫瘤免疫防御體系中發(fā)揮關鍵作用,但由于它的激活往往受到抑制性和刺激性免疫檢查點的控制,因此免疫檢查點分子的表達紊亂會助力癌細胞的免疫逃逸。雖然阻斷PD-L1等抑制性免疫檢查點蛋白是目前大多數癌癥免疫療法的重要靶標,但免疫共刺激信號的缺乏可能會使這些療法收效甚微甚至毫無用處。

CD58是一種共刺激配體,在細胞的抗腫瘤免疫應答中起著至關重要的作用,但控制其表達的機制尚不明朗。近日,發(fā)表在《Cancer Cell》上題為“CMTM6 shapes antitumor T cell response through modulating protein expression of CD58 and PD-L1”的研究發(fā)現,CMTM6可以同時正向調控免疫共刺激因子CD58和免疫共抑制因子PD-L1,進而影響T細胞的抗腫瘤反應。這無疑為新型免疫療法的開發(fā)打開了新思路。

圖1. 研究思路示意圖(圖片源自《Cancer Cell》)

 

CMTM6在腫瘤細胞中共同調控CD58和PD-L1

前期研究發(fā)現CMTM6是PD-L1的正調節(jié)因子和分子伴侶,基于此作者定量分析了CMTM6缺失和CMTM6正常表達腫瘤細胞的總蛋白質組。發(fā)現在CMTM6缺陷細胞中,除了PD-L1表達降低外,CD58(LFA-3)也顯著下調。

鑒于CD58在抗腫瘤免疫應答中的關鍵作用,作者進行了基于FACS的單倍體遺傳篩選,以系統(tǒng)地鑒定該蛋白的調控者。結果發(fā)現在CD58low細胞群體中CD58位點的破壞性插入高度富集。此外,鑒定出糖基磷脂酰肌醇(GPI)生物合成途徑的組分和內質網轉位復合物是CD58表達的調節(jié)因子,而CMTM6也是其中最重要的調節(jié)因子之一。

為了驗證這一發(fā)現,作者敲除了HAP1細胞系中的CMTM6。發(fā)現與親代HAP1細胞相比,CMTM6缺陷細胞表面CD58表達降低。此外,在CMTM6缺陷細胞中重新加入CMTM6表達可以恢復CD58的表達。

上述比較蛋白質組學分析和單倍體遺傳篩選均顯示CMTM6是CD58免疫檢查點的正調節(jié)因子。

由于CMTM6先前已被證明維持PD-L1蛋白的表達,綜合上述結果研究者提出了一個大膽假設:共刺激和共抑制免疫檢查點配體的表達由相同的調節(jié)蛋白控制。

為了驗證這一假設,作者在多種癌癥類型的細胞系中進行了CMTM6的缺失和重構,包括8505C甲狀腺癌細胞、A375黑色素瘤細胞和RKO結直腸癌細胞。在A375細胞中,IFNγ誘導PD-L1表達,而CD58表達不受細胞因子暴露的影響。CRISPR-Cas9破壞CMTM6會降低細胞表面CD58和PD-L1的總蛋白水平。相反,CMTM6的重組恢復了兩種免疫檢查點配體的表達。在CD58和PD-L1基礎表達水平較高的8505C和RKO細胞中,CMTM6缺失同時下調了這兩種免疫檢查點配體,而重新引入CMTM6則恢復了這種表型。

 

 

圖2. CMTM6在腫瘤細胞中共同調控CD58和PD-L1(圖片源自《Cancer Cell》)

 

CMTM6維持CD58蛋白的穩(wěn)定性并與之相互作用

為探究CMTM6介導的CD58調控機制,研究者首先比較了CMTM6缺乏和正常表達細胞中CD58的mRNA水平。發(fā)現CMTM6缺失不會降低CD58的RNA轉錄物水平,但會顯著降低細胞表面和總CD58蛋白水平,表明這種調控發(fā)生在轉錄后水平。由于CMTM6包含一個四元跨越的MARVEL(MAL)結構域以及用于囊泡運輸和膜連接的相關蛋白,能促進PD-L1的內吞循環(huán)并保護PDL1免于泛素化。基于此作者推測CMTM6可以通過類似的機制調節(jié)CD58的表達。為了研究這一點,他們用別藻藍蛋白(allophycocyanin, APC)偶聯(lián)CD58特異性抗體標記細胞表面表達的CD58,追蹤和定量APC信號隨時間的變化。分析顯示,在CMTM6缺失的情況下,細胞表面CD58的衰減速度更快。

在真核細胞中,蛋白質降解主要通過蛋白酶體和溶酶體蛋白水解途徑發(fā)生。隨后,研究者們用蛋白酶體或溶酶體酸化抑制劑孵育細胞。發(fā)現兩種抑制劑都延遲了熒光信號的衰減。值得注意的是,溶酶體抑制顯著降低了CMTM6缺陷細胞中CD58的降解率,其水平與CMTM6正常細胞相似。這些結果表明CMTM6保護細胞表面CD58免受溶酶體介導的降解。

由于CMTM6與PDL1和CD58共定位并調節(jié)其穩(wěn)定性,研究者接下來評估了這三種分子之間可能的相互作用。他們用抗CMTM6、抗CD58和抗PD-L1抗體進行了免疫共沉淀和免疫印跡分析。在A375細胞裂解物的抗CMTM6免疫沉淀中,檢測到CD58和PD-L1。同樣,CMTM6也存在于抗CD58和抗PD-L1免疫沉淀中。然而,在抗CD58免疫沉淀中未檢測到PD-L1,反之亦然。因此,表明CD58和PD-L1之間不存在直接的相互作用。隨后,作者又通過細胞表面免疫沉淀實驗來確定CMTM6是否與細胞表面PD-L1和CD58分子相互作用,發(fā)現PD-L1水平在CD58缺失的A375細胞中略有升高。隨著PDL1水平的升高,PD-L1與CMTM6之間的關聯(lián)增加。相比之下,腫瘤細胞中PD-L1的缺失并沒有導致CD58水平或CMTM6/CD58相互作用的明顯增加。

 

 

圖3. CMTM6促進細胞表面CD58的穩(wěn)定性并與之互作(圖片源自《Cancer Cell》)

 

CMTM6和CD58在T細胞激活和T細胞-腫瘤互作中的作用

研究者進一步評估了腫瘤細胞中CMTM6對T細胞激活的影響。他們共培養(yǎng)了由T細胞1(MART-1)抗原負載的腫瘤細胞識別的黑色素瘤抗原和用MART-1特異性T細胞受體轉導的T細胞。在腫瘤識別后,T細胞顯示出激活標記物(CD137、CD69、IL-2和TNF-a)的表達增加。此外,PD-L1阻斷進一步增強了T細胞的活化,而CD58阻斷具有相反的效果。

通過這種共培養(yǎng)模型,他們發(fā)現,與野生型和CMTM6重組的腫瘤細胞相比,和CMTM6敲除的腫瘤細胞孵育顯著降低了T細胞激活標志物(CD137和CD69)和T細胞效應因子(IL-2和TNFa)的表達。同樣,CMTM6缺失導致腫瘤細胞活力顯著增加。

考慮到CMTM6在維持細胞表面CD58和PD-L1表達中的雙重作用,作者試圖確定這兩個在T細胞-腫瘤細胞相互作用中具有相反功能的免疫檢查點的相對重要性。值得注意的是,當CD58和PD-L1同時被阻斷時,在CD2high和PD-1+T細胞群中,單獨阻斷PD-L1所觀察到的T細胞活化增強被完全消除。實際上,PD-L1和CD58的共抑制使CD2high和CD2inter T細胞的活化水平低于未處理的對照組,表明CD58阻斷的主導作用。在A375和8505C細胞的共培養(yǎng)系統(tǒng)中,都觀察到CD58阻斷對T細胞活化的顯著影響。上述數據表明,CD58在抗原特異性T細胞-腫瘤細胞相互作用和對PD-L1阻斷的反應中起著至關重要的作用。

此外,他們還觀察到A375或8505C細胞中CMTM6的缺失導致腫瘤細胞存活率增加。PD-L1抑制增強了T細胞對腫瘤細胞的殺傷,而CD58的抑制則顯著挽救了腫瘤細胞。與CMTM6缺陷細胞相比。CD58敲除消除了CMTM6正常表達細胞和CMTM6缺乏細胞對腫瘤特異性T細胞和PD-L1阻斷的差異反應。相反,當CD58在CMTM6缺陷和CMTM6正常表達的腫瘤細胞中過表達時,這些細胞的活力在與腫瘤反應性T細胞共培養(yǎng)后下降到一個相對穩(wěn)定的水平。這些發(fā)現強調了CD58在抗原特異性T細胞-腫瘤細胞相互作用和PD-L1阻斷反應中的重要作用,CMTM6介導的CD58調控在此背景下發(fā)揮了重要作用。

 

 

圖4. CMTM6、CD58和PD-L1對抗原特異性T細胞-腫瘤細胞相互作用的影響

(圖片源自《Cancer Cell》)

 

CMTM6和CD58在腫瘤細胞中的表達與ICB治療的臨床反應呈正相關

為了研究人類癌癥中CMTM6和CD58表達之間的關系,研究者們使用CMTM6或CD58的抗體對88個黑色素瘤樣本和102個結腸癌樣本進行了免疫組織化學(IHC)分析。結果顯示,CMTM6和CD58在兩種癌癥類型樣本的腫瘤細胞中廣泛分布且大部分重疊表達(4C)。他們觀察到在88個黑素瘤中有77個的CD58染色主要出現在的CMTM6表達區(qū)域。此外,他們對CMTM6和CD58在腫瘤細胞上的蛋白表達水平進行了量化,發(fā)現它們在腫瘤細胞中的表達存在顯著相關性。

為了評估CMTM6和CD58表達與ICB治療反應之間的關系,他們分析了88例晚期黑色素瘤患者的腫瘤活檢。這些患者隨后接受了抗PD-1或抗PD-1/抗CTLA4治療。結果顯示CMTM6或CD58在這些治療組之間的表達無顯著差異。同時,較高水平的CMTM6或CD58表達與對ICB治療的有利反應顯著相關。這些發(fā)現強調了CMTM6介導的CD58調控在人類腫瘤中的相關性,并提示其在調節(jié)對ICB治療的反應中可能起著關鍵作用。

 

圖5. 腫瘤細胞中CMTM6調控CD58表達以及它們與ICB治療反應之間的關系

(圖片源自《Cancer Cell》)

 

免疫檢查點通路在TME中經常失調,從而促進癌癥的進一步發(fā)展并造成免疫治療的耐藥性。因此,解碼調節(jié)免疫檢查點分子的分子機制對于理解癌癥中的免疫調節(jié)至關重要,并且可能預測免疫檢查點療法的反應并提供新的治療途徑。

 

云克隆開發(fā)了上述研究中涉及的相關指標的蛋白、抗體、ELISA試劑盒等產品以助力腫瘤治療相關研究,部分指標節(jié)選如下,供參考:

指標名

核心貨號

指標名

核心貨號

CD58

A903

SRD5A2

M582

PDL1

A788

PLK3

G785

CD2

B576

CYP24A1

D543

PD1

A751

ATR

D751

CTLA4

B230

PDK3

D463

EZH2

K073

ITPR1

E845

FDX1

C475

TNFA

A133

IL-2

A073

IFNg

A049

 

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