返老還童?不再是夢(mèng)!——重塑心肌細(xì)胞能量代謝方式可實(shí)現(xiàn)心臟再生
心臟再生一直以來(lái)都是心血管疾病研究領(lǐng)域的重點(diǎn)和前沿。動(dòng)物出生后,心肌細(xì)胞的能量代謝就從糖酵解轉(zhuǎn)變?yōu)檠趸x。與此同時(shí),大多數(shù)心肌細(xì)胞發(fā)生染色質(zhì)重構(gòu)和退出細(xì)胞周期。這就阻止了心肌細(xì)胞分裂,為成人心臟再生形成了一種天然的屏障。近期,德國(guó)馬克斯·普朗克心肺研究所研究人員在《Nature》上發(fā)表了題為“Inhibition of fatty acid oxidation enables heart regeneration in adult mice”的研究探索了代謝重編程在克服心臟再生障礙中的作用。研究發(fā)現(xiàn),阻斷脂肪酸氧化能提高心肌細(xì)胞對(duì)缺氧的抵抗力,刺激心肌細(xì)胞增殖,使缺血-再灌注損傷后的心臟再生。
研究人員首先對(duì)成年小鼠的心肌細(xì)胞(cardiomyocytes,CMs)進(jìn)行了RNA測(cè)序(RNA-seq),數(shù)據(jù)分析顯示,在出生后第一周CMs成熟過(guò)程中,糖酵解和細(xì)胞周期進(jìn)展相關(guān)的幾個(gè)關(guān)鍵基因的表達(dá)水平降低,而與脂肪酸氧化(FAO)和三羧酸循環(huán)(TAC)相關(guān)的基因發(fā)生了上調(diào)。上調(diào)的FAO相關(guān)基因包括肉毒堿棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶(Cpt1b)的肌肉特異性亞型,但不包括普遍表達(dá)的Cpt1b亞型,而這一普遍表達(dá)亞型是線粒體攝取脂肪酸以及隨后的FAO所必需的。
為了探索FAO在CMs成熟和增殖中的潛在作用,研究人員構(gòu)建了Cpt1b敲除(Cpt1bcKO)小鼠模型。觀察發(fā)現(xiàn),與對(duì)照小鼠相比,Cpt1bcKO小鼠的體重(BW)、心臟重量(HW)、HW/BW比值和心臟形態(tài)均未發(fā)生變化。然而,由于心肌的同心生長(zhǎng)模式,10周齡Cpt1bcKO小鼠的心臟大小、HW和HW/BW比都增加。而且Cpt1bcKO小鼠心臟中CMs的絕對(duì)數(shù)量增加了一倍。此外,Cpt1bcKO小鼠的CM表面積相對(duì)適度增加,這表明心肌同時(shí)發(fā)生增生性和肥厚性生長(zhǎng)。形態(tài)學(xué)評(píng)價(jià)顯示,最小CMs(<100μm2)群體顯著增加,表明Cpt1b失活后會(huì)形成新的CMs,中等大小CMs(100~300 μm2)的比例下降,而較大CMs(>300μm2)的數(shù)量顯著增加,反映了CMs表面積的總體增加。這些數(shù)據(jù)表明,Cpt1b的缺失會(huì)刺激CMs的增殖,而CMs增殖通常在出生一周內(nèi)在小鼠心臟中終止。
圖1. Cpt1b失活誘導(dǎo)CMs增生和肥厚生長(zhǎng)
(圖片源自《Nature》)
為了研究Cpt1b失活和隨后的CMs增殖是否能夠促進(jìn)心臟再生,研究人員對(duì)Cpt1bcKO小鼠進(jìn)行了缺血-再灌注(I–R)損傷模型構(gòu)建,該模型與人類冠狀動(dòng)脈阻塞患者進(jìn)行支架重建的情況非常相似。結(jié)果發(fā)現(xiàn),與對(duì)照動(dòng)物相比,3周后,Cpt1bcKO小鼠幾乎沒(méi)有I-R誘導(dǎo)的疤痕,盡管在I-R手術(shù)后24h兩個(gè)突變心臟的風(fēng)險(xiǎn)區(qū)域(AAR)相似。這表明,阻斷FAO獲得的增殖潛力允許先前存在的CMs重新進(jìn)入細(xì)胞周期并有助于心臟再生。同時(shí),研究者檢測(cè)到Cpt1bcKO小鼠在I-R損傷24h后,AAR內(nèi)梗死面積減少,而在I-R損傷48h后,Cpt1bcKO小鼠心臟收縮變強(qiáng),這表明抑制FAO也可以保護(hù)小鼠免受I-R損傷。組織學(xué)分析顯示,與對(duì)照組相比,Cpt1bcKO小鼠的纖維瘢痕面積明顯減少。他們還觀察到I-R手術(shù)后4周,心臟功能的恢復(fù)程度幾乎達(dá)到了損傷前的水平,這明確地證明了cpt1b失活促進(jìn)了心臟再生。CM增殖和心臟保護(hù)增強(qiáng)有助于減少FAO缺乏小鼠冠狀動(dòng)脈閉塞后的疤痕形成。
圖2. cpt1b介導(dǎo)的FAO阻斷可防止I-R損傷并使心臟再生
(圖片源自《Nature》)
接下來(lái),作者探究了FAO的阻斷如何重新編程CMs代謝。代謝通量和海馬實(shí)驗(yàn)表明,長(zhǎng)鏈脂肪酸的利用在Cpt1bcKO 的CMs中被有效抑制,沒(méi)有觀察到cpt1無(wú)關(guān)的中鏈或短鏈脂肪酸的明顯代償性使用。此外,靶向代謝組學(xué)分析顯示,來(lái)自中鏈和長(zhǎng)鏈脂肪酸的酰基肉毒堿水平在Cpt1b缺陷的CMs中顯著降低,而細(xì)胞內(nèi)游離肉毒堿水平顯著升高。出乎意料的是,細(xì)胞內(nèi)乙酰輔酶A水平和TAC的大多數(shù)代謝產(chǎn)物沒(méi)有顯著改變,這表明在缺乏FAO的情況下,CMs會(huì)通過(guò)不同形式產(chǎn)能量。
隨后,作者對(duì)另一個(gè)潛在的能量來(lái)源氨基酸進(jìn)行了檢測(cè)。發(fā)現(xiàn)與氨基酸轉(zhuǎn)化有關(guān)代謝物的顯著富集,幾種參與TAC的氨基酸中間體表達(dá)水平也顯著增加。同樣,作者發(fā)現(xiàn)在Cpt1b缺陷的CMs中,支鏈氨基酸(BCAA)分解代謝的代謝物水平顯著升高。因此,作者推斷Cpt1b缺陷的CMs中葡萄糖氧化和BCAA分解代謝的增強(qiáng)有效地補(bǔ)償了脂肪酸衍生的乙酰輔酶A進(jìn)入三羧酸循環(huán)的代謝通量受損。
值得注意的是,Cpt1b失活后,CMs中α酮戊二酸(αKG)顯著增加了近20倍。因?yàn)楣劝滨0泛凸劝彼岬臐舛榷紱](méi)有下降,谷氨酰胺和谷氨酸直接轉(zhuǎn)化為αKG似乎不能解釋?duì)罧G的積累。相反,他們觀察到異檸檬酸水平顯著降低,同時(shí)催化異檸檬酸轉(zhuǎn)化為αKG的異檸檬酸脫氫酶IDH1、IDH2和IDH3A水平升高。此外,在Cpt1b缺失的CMs中,將αKG脫氫酶復(fù)合物轉(zhuǎn)化為琥珀酰輔酶a的關(guān)鍵組分OGDH的酶活性有所降低。說(shuō)明Cpt1b和αKG積累的失活不影響其他三羧酸循環(huán)的蛋白水平。上述結(jié)果表明,在阻斷FAO后,合成水平的提高和代謝水平的降低協(xié)同作用使αKG在CMs中積累。
圖3. 線粒體脂肪酸輸入受阻引起CMs代謝發(fā)生改變和αKG水平升高
(圖片源自《Nature》)
由于αKG是組蛋白去甲基化酶的重要輔因子。因此,研究人員接著探究了Cpt1b缺陷CMs中αKG的積累是否影響組蛋白甲基化。通過(guò)熒光激活細(xì)胞分選(FACS)對(duì)細(xì)胞核進(jìn)行不同組蛋白賴氨酸甲基化修飾的分析顯示,只有H3K4me3水平降低,而其他11種組蛋白賴氨酸甲基化修飾的水平?jīng)]有降低。而在Cpt1b失活后,異染色質(zhì)標(biāo)記物如H3K9me3、H3K27me3和H4K20me2的水平顯著增加,這可能是由于CMs向未成熟狀態(tài)轉(zhuǎn)變帶來(lái)的次級(jí)效應(yīng)。因此,作者得出結(jié)論,αKG增強(qiáng)了H3K4me3特異性去甲基化酶的活性,最終導(dǎo)致H3K4me3水平的降低。
使用FACS分選的CM核對(duì)H3K4me3進(jìn)行染色質(zhì)免疫沉淀測(cè)序(Chip-seq)分析以定位H3K4me3調(diào)控變化的基因區(qū)域,發(fā)現(xiàn)在與CM成熟相關(guān)的基因的啟動(dòng)子和基因區(qū)域,H3K4me3富集程度普遍降低,而啟動(dòng)子處的H3K9me3和H3K27me3水平保持不變。這些發(fā)現(xiàn)表明,αKG的積累激活了H3K4me3特異性去甲基化酶,使其在心臟分化和成熟所需的基因內(nèi)清除H3K4me3,從而將Cpt1b缺陷型CM向更不成熟的、具有增殖能力的狀態(tài)進(jìn)行轉(zhuǎn)變。
圖4. αKG表達(dá)量升高誘導(dǎo)H3K4me3去甲基化從而降低CM成熟基因表達(dá)水平
(圖片源自《Nature》)
為了證實(shí)αKG的積累是阻止CM成熟和促進(jìn)增殖的關(guān)鍵信號(hào),研究人員用細(xì)胞滲透性αKG處理P0-1新生小鼠的CMs 4天。觀察到在胎兒新生階段表達(dá)的基因水平顯著升高,而與CM成熟和分化相關(guān)的基因水平降低。另外,用αKG處理也能降低H3K4me3修飾水平,但不影響H3K9和H4K20甲基化。用CPI-455 (αKG依賴性H3K4去甲基化酶KDM5的特異性抑制劑)或細(xì)胞滲透性R2HG (αKG29的競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑)治療新生兒CMs,可阻止αKG誘導(dǎo)的細(xì)胞周期活性增強(qiáng)或異檸檬酸脫氫酶Idh3b或Idh3g的過(guò)表達(dá)。KDM5抑制劑CPI-455對(duì)αKG依賴性的藥理學(xué)抑制表明,αKG對(duì)染色質(zhì)和基因表達(dá)的影響是由 KDM5基因家族成員傳遞的。Kdm5b過(guò)表達(dá)證實(shí)了這一假設(shè),當(dāng)與αKG聯(lián)合處理時(shí),Kdm5b可顯著降低H3K4me3水平,并顯著增加CM細(xì)胞周期活性。Kdm5b敲低能有效拮抗αKG的促增殖作用,并能完全恢復(fù)αKG處理后降低的H3K4me3水平,從而使與CM成熟相關(guān)的幾個(gè)關(guān)鍵基因的表達(dá)量上升。
圖5. αKG積累會(huì)激活KDM5從而減緩CMs的成熟并促進(jìn)CMs增殖
(圖片源自《Nature》)
總的來(lái)說(shuō),該研究通過(guò)對(duì)細(xì)胞能量代謝的重編程來(lái)重啟CMs分裂能力,這一發(fā)現(xiàn)具有開(kāi)創(chuàng)性意義,可能為心肌疾病提供全新的療法。
云克隆開(kāi)發(fā)了上述研究中相關(guān)指標(biāo)產(chǎn)品以助力科學(xué)研究,部分指標(biāo)如下,供您參考:
<td margin-top:20px;margin-bottom:20px;text-align:center">指標(biāo)名稱
指標(biāo)名稱 | 核心貨號(hào) | ||
PKM2 | A588 | PDK4 | A958 |
CPT1B | F369 | ACSS1 | D670 |
ACSS2 | D672 | OGDH | G187 |
Mylk3 | D429 | Acta1 | B634 |
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